S'il n'avait pas été restauré profondément et même pratiquement reconstruit au 19e siècle, il serait resté l'exemple le plus important de l'architecture civile veneto-byzantine.

Il fut construit par le riche marchand Pesaro Palmieri, et racheté par le gouvernement de la république en 1381 pour loger le marquis de Ferrare Nicola V, puis l'Empereur Jean Paleologue en 1438 et Alphonse d'Este en 1562.

En 1621, l'Etat vénitien le céda aux marchands turcs qui en firent le centre de leur importante activité commerciale.

En 1858, malheureusement une reconstruction arbitraire endommagea définitivement la beauté originelle de l'édifice. Seule la façade fut en partie préservée. Les imposantes arcades du rez-de-chaussée font penser au style roman tardif.

La magnifique loggia aux 18 arcs byzantins couvre toute la façade entre les deux tours (torresselle) ornées de patères et de blasons.

Le Fondaco dei Turchi est aujourd’hui le Musée d'histoire naturelle, de la flore et de la faune de la lagune.